Protein–RNA interactions for Protein: O60356

NUPR1, Nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPR1O60356 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUPR1O60356 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
NUPR1O60356 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms