Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP8B1O43520 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP8B1O43520 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms