Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HOXA3O43365 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HOXA3O43365 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms