Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXA2O43364 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXA2O43364 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms