Protein–RNA interactions for Protein: O43157

PLXNB1, Plexin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 2,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNB1O43157 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PLXNB1O43157 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PLXNB1O43157 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms