Protein–RNA interactions for Protein: O15270

SPTLC2, Serine palmitoyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC2O15270 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SPTLC2O15270 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPTLC2O15270 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms