Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LAMA5O15230 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMA5O15230 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMA5O15230 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.33■■□□□ 1
LAMA5O15230 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LAMA5O15230 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LAMA5O15230 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LAMA5O15230 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
LAMA5O15230 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LAMA5O15230 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LAMA5O15230 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA5O15230 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA5O15230 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA5O15230 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA5O15230 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA5O15230 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA5O15230 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA5O15230 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA5O15230 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA5O15230 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LAMA5O15230 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LAMA5O15230 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA5O15230 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LAMA5O15230 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA5O15230 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA5O15230 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA5O15230 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA5O15230 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA5O15230 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA5O15230 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LAMA5O15230 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA5O15230 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA5O15230 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA5O15230 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA5O15230 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA5O15230 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA5O15230 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA5O15230 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LAMA5O15230 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA5O15230 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA5O15230 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LAMA5O15230 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.3■■□□□ 1
LAMA5O15230 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA5O15230 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA5O15230 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA5O15230 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA5O15230 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA5O15230 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA5O15230 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LAMA5O15230 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA5O15230 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA5O15230 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA5O15230 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LAMA5O15230 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA5O15230 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA5O15230 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA5O15230 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LAMA5O15230 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms