Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR1CO15160 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
POLR1CO15160 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
POLR1CO15160 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms