Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
POLR3AO14802 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
POLR3AO14802 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC31.3■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
POLR3AO14802 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms