Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F3O00716 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
E2F3O00716 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2F3O00716 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2F3O00716 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2F3O00716 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E2F3O00716 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F3O00716 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F3O00716 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F3O00716 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F3O00716 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F3O00716 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F3O00716 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E2F3O00716 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F3O00716 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F3O00716 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F3O00716 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F3O00716 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F3O00716 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F3O00716 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F3O00716 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F3O00716 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F3O00716 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F3O00716 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F3O00716 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F3O00716 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F3O00716 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F3O00716 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E2F3O00716 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F3O00716 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F3O00716 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F3O00716 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F3O00716 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F3O00716 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F3O00716 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F3O00716 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F3O00716 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F3O00716 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F3O00716 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F3O00716 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F3O00716 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F3O00716 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E2F3O00716 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F3O00716 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F3O00716 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F3O00716 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F3O00716 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F3O00716 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F3O00716 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F3O00716 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F3O00716 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E2F3O00716 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F3O00716 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F3O00716 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F3O00716 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F3O00716 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F3O00716 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F3O00716 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F3O00716 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F3O00716 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F3O00716 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F3O00716 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F3O00716 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F3O00716 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E2F3O00716 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F3O00716 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F3O00716 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F3O00716 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F3O00716 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F3O00716 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
E2F3O00716 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F3O00716 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F3O00716 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F3O00716 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F3O00716 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F3O00716 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F3O00716 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F3O00716 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F3O00716 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E2F3O00716 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2F3O00716 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2F3O00716 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2F3O00716 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
E2F3O00716 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F3O00716 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F3O00716 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F3O00716 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F3O00716 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F3O00716 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E2F3O00716 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F3O00716 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F3O00716 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F3O00716 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F3O00716 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F3O00716 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F3O00716 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F3O00716 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F3O00716 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F3O00716 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E2F3O00716 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms