Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
POLRMTO00411 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
POLRMTO00411 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
POLRMTO00411 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms