Protein–RNA interactions for Protein: O00311

CDC7, Cell division cycle 7-related protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC7O00311 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC7O00311 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC7O00311 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC7O00311 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC7O00311 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC7O00311 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CDC7O00311 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC7O00311 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC7O00311 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC7O00311 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC7O00311 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC7O00311 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC7O00311 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC7O00311 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC7O00311 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CDC7O00311 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CDC7O00311 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC7O00311 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC7O00311 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC7O00311 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC7O00311 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC7O00311 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC7O00311 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC7O00311 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC7O00311 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC7O00311 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CDC7O00311 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC7O00311 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC7O00311 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC7O00311 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC7O00311 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC7O00311 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC7O00311 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC7O00311 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC7O00311 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC7O00311 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CDC7O00311 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC7O00311 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC7O00311 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC7O00311 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC7O00311 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC7O00311 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC7O00311 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC7O00311 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC7O00311 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC7O00311 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC7O00311 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC7O00311 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC7O00311 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC7O00311 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC7O00311 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC7O00311 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC7O00311 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC7O00311 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC7O00311 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC7O00311 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC7O00311 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC7O00311 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC7O00311 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC7O00311 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC7O00311 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC7O00311 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC7O00311 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC7O00311 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC7O00311 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC7O00311 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC7O00311 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC7O00311 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC7O00311 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC7O00311 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC7O00311 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC7O00311 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC7O00311 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC7O00311 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC7O00311 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC7O00311 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDC7O00311 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDC7O00311 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC7O00311 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC7O00311 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC7O00311 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC7O00311 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC7O00311 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC7O00311 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC7O00311 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC7O00311 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC7O00311 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC7O00311 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC7O00311 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC7O00311 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC7O00311 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC7O00311 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC7O00311 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC7O00311 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC7O00311 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC7O00311 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC7O00311 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC7O00311 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC7O00311 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC7O00311 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms