Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMIM22K7EJ46 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMIM22K7EJ46 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SMIM22K7EJ46 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms