Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QKU1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QKU1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QKU1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QKU1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QKU1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QKU1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
J3QKU1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QKU1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QKU1 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QKU1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QKU1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QKU1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QKU1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QKU1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
J3QKU1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QKU1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QKU1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QKU1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QKU1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QKU1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QKU1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QKU1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QKU1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
J3QKU1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
J3QKU1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
J3QKU1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
J3QKU1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
J3QKU1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
J3QKU1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
J3QKU1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
J3QKU1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
J3QKU1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
J3QKU1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QKU1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QKU1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QKU1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QKU1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QKU1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QKU1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QKU1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QKU1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QKU1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QKU1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QKU1 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
J3QKU1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QKU1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QKU1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QKU1 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QKU1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QKU1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QKU1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QKU1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QKU1 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QKU1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QKU1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QKU1 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QKU1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QKU1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
J3QKU1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QKU1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QKU1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QKU1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QKU1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QKU1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QKU1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QKU1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QKU1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QKU1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QKU1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QKU1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QKU1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
J3QKU1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QKU1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QKU1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QKU1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QKU1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QKU1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QKU1 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QKU1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
J3QKU1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QKU1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QKU1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QKU1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QKU1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QKU1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QKU1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QKU1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
J3QKU1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QKU1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QKU1 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QKU1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QKU1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QKU1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QKU1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
J3QKU1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QKU1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QKU1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QKU1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
J3QKU1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
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