Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CROCC2H7BZ55 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CROCC2H7BZ55 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CROCC2H7BZ55 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms