Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
USP17L12C9JPN9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
USP17L12C9JPN9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
USP17L12C9JPN9 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms