Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMCO5BA8MYB1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMCO5BA8MYB1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms