Protein–RNA interactions for Protein: A6NNP5

CCDC169, Coiled-coil domain-containing protein 169, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC169A6NNP5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC169A6NNP5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC169A6NNP5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC169A6NNP5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms