Protein–RNA interactions for Protein: A6NN92

GJE1, Gap junction epsilon-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJE1A6NN92 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJE1A6NN92 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJE1A6NN92 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJE1A6NN92 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJE1A6NN92 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJE1A6NN92 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GJE1A6NN92 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJE1A6NN92 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GJE1A6NN92 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GJE1A6NN92 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJE1A6NN92 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJE1A6NN92 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJE1A6NN92 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJE1A6NN92 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJE1A6NN92 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJE1A6NN92 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJE1A6NN92 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GJE1A6NN92 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJE1A6NN92 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJE1A6NN92 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJE1A6NN92 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJE1A6NN92 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJE1A6NN92 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GJE1A6NN92 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms