Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
ZNF316A6NFI3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
ZNF316A6NFI3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
ZNF316A6NFI3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96 ms