Protein–RNA interactions for Protein: A4D1S5

RAB19, Ras-related protein Rab-19, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB19A4D1S5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RAB19A4D1S5 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RAB19A4D1S5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB19A4D1S5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB19A4D1S5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB19A4D1S5 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB19A4D1S5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB19A4D1S5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RAB19A4D1S5 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RAB19A4D1S5 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms