Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRAMEF22A3QJZ6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRAMEF22A3QJZ6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
PRAMEF22A3QJZ6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms