Protein–RNA interactions for Protein: A2RUS2

DENND3, DENN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND3A2RUS2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
DENND3A2RUS2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DENND3A2RUS2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DENND3A2RUS2 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DENND3A2RUS2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DENND3A2RUS2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND3A2RUS2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND3A2RUS2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND3A2RUS2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND3A2RUS2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND3A2RUS2 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND3A2RUS2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND3A2RUS2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND3A2RUS2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND3A2RUS2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND3A2RUS2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND3A2RUS2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DENND3A2RUS2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND3A2RUS2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND3A2RUS2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DENND3A2RUS2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms