Protein–RNA interactions for Protein: A2RUB6

CCDC66, Coiled-coil domain-containing protein 66, humanhuman

Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC66A2RUB6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC66A2RUB6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC66A2RUB6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC66A2RUB6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms