Protein–RNA interactions for Protein: A0PK05

TMEM72, Transmembrane protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM72A0PK05 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM72A0PK05 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM72A0PK05 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms