Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RRI6

CENPVL3, Centromere protein V-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL3A0A0U1RRI6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CENPVL3A0A0U1RRI6 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CENPVL3A0A0U1RRI6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms