Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
A0A0J9YVX5 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
A0A0J9YVX5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms