Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 LIPA-202ENST00000336233 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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COPS3Q9UNS2 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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COPS3Q9UNS2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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COPS3Q9UNS2 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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COPS3Q9UNS2 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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COPS3Q9UNS2 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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COPS3Q9UNS2 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
COPS3Q9UNS2 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
COPS3Q9UNS2 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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