Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CLIP2Q9UDT6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms