Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBA6

C6orf48, Protein G8, humanhuman

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Length 75 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48Q9UBA6 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC9.59□□□□□ -0.87
C6orf48Q9UBA6 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.88
C6orf48Q9UBA6 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C6orf48Q9UBA6 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
C6orf48Q9UBA6 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C6orf48Q9UBA6 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C6orf48Q9UBA6 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
C6orf48Q9UBA6 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
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