Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CNTN3Q9P232 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CNTN3Q9P232 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms