Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 PAX6-247ENST00000638965 979 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TMPRSS4Q9NRS4 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TMPRSS4Q9NRS4 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms