Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PTPRHQ9HD43 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTPRHQ9HD43 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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