Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 KRTAP4-12-201ENST00000394014 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 AC073987.1-201ENST00000422683 638 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 PQLC2L-206ENST00000468043 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 AC007224.2-201ENST00000625011 510 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 UBE2D3-202ENST00000338145 896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 AC009055.1-201ENST00000562656 781 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM106CQ9BVX2 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM106CQ9BVX2 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms