Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GCNAQ96QF7 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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