Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SIRT1Q96EB6 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 ZNF737-204ENST00000596797 569 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 CCL3L3-203ENST00000619989 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 RNF34-211ENST00000613529 1449 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SIRT1Q96EB6 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.3 ms