Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAT5

NEIL3, Endonuclease 8-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL3Q8TAT5 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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NEIL3Q8TAT5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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NEIL3Q8TAT5 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
NEIL3Q8TAT5 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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NEIL3Q8TAT5 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEIL3Q8TAT5 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEIL3Q8TAT5 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEIL3Q8TAT5 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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NEIL3Q8TAT5 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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NEIL3Q8TAT5 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEIL3Q8TAT5 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEIL3Q8TAT5 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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NEIL3Q8TAT5 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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NEIL3Q8TAT5 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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NEIL3Q8TAT5 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEIL3Q8TAT5 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NEIL3Q8TAT5 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEIL3Q8TAT5 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEIL3Q8TAT5 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEIL3Q8TAT5 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEIL3Q8TAT5 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NEIL3Q8TAT5 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEIL3Q8TAT5 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEIL3Q8TAT5 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
NEIL3Q8TAT5 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEIL3Q8TAT5 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
NEIL3Q8TAT5 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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