Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 EPS15L1-202ENST00000455140 3266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 STRA6-222ENST00000616000 2843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 SIX1-203ENST00000554986 1959 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CHRNA2-207ENST00000520933 2497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CYB561D1-206ENST00000496961 3424 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ELN-222ENST00000458204 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 MCRIP1-212ENST00000576730 2979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TECPR1-204ENST00000447648 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PDE9A-202ENST00000328862 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 GRM1-202ENST00000355289 3874 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
KHDC3LQ587J8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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