Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CTBP1-AS-201ENST00000625256 3886 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC104129.1-202ENST00000480694 4481 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HSD17B12Q53GQ0 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms