Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q499Y3 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q499Y3 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q499Y3 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Q499Y3 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q499Y3 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q499Y3 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q499Y3 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q499Y3 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Q499Y3 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Q499Y3 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Q499Y3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms