Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LETM2Q2VYF4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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