Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2W7

C17orf58, UPF0450 protein C17orf58, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf58Q2M2W7 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 USP17L6P-201ENST00000382470 1197 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
C17orf58Q2M2W7 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms