Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2B3Q16720 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2B3Q16720 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2B3Q16720 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2B3Q16720 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2B3Q16720 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2B3Q16720 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2B3Q16720 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2B3Q16720 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2B3Q16720 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2B3Q16720 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2B3Q16720 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2B3Q16720 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2B3Q16720 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2B3Q16720 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2B3Q16720 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2B3Q16720 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2B3Q16720 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2B3Q16720 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2B3Q16720 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ATP2B3Q16720 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP2B3Q16720 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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