Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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SYCP1Q15431 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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SYCP1Q15431 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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SYCP1Q15431 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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SYCP1Q15431 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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SYCP1Q15431 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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SYCP1Q15431 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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SYCP1Q15431 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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SYCP1Q15431 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SYCP1Q15431 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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