Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 CTLA4-201ENST00000295854 525 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 RPL10L-201ENST00000298283 812 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 IGFL4-201ENST00000377697 573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC139143.1-201ENST00000441772 1207 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 NPTN-205ENST00000563691 1214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC008764.4-207ENST00000600705 956 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 WNT8A-202ENST00000398754 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 COA6-201ENST00000366612 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 MRPL55-209ENST00000366735 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CAP2-207ENST00000493172 861 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 RNA5SP491-201ENST00000362936 118 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 MKL1-204ENST00000402630 747 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
R3HDM1Q15032 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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