Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ZNF576-202ENST00000391965 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
FRMPD4Q14CM0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms