Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 C18orf21-202ENST00000333234 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 FAM3D-AS1-201ENST00000464125 821 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TMEM9B-202ENST00000525069 1433 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 PCLAF-202ENST00000380258 911 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 C11orf1-202ENST00000528125 534 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ZNF175-204ENST00000596504 580 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SMAD4Q13485 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD4Q13485 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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