Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 BCL2L1-203ENST00000376062 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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LSAMPQ13449 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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LSAMPQ13449 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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LSAMPQ13449 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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LSAMPQ13449 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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LSAMPQ13449 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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LSAMPQ13449 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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LSAMPQ13449 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 GPD1-201ENST00000301149 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 SLC48A1-201ENST00000442218 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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LSAMPQ13449 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 LINC01428-201ENST00000449581 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CAST-223ENST00000508608 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LSAMPQ13449 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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