Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 GBA3-201ENST00000503442 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC092535.2-201ENST00000513176 1204 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MORF4L1P3-201ENST00000525966 950 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC026254.4-201ENST00000581118 454 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC104984.3-201ENST00000581946 546 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AL034405.1-201ENST00000432062 526 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC051619.5-203ENST00000561404 529 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ZRANB2-207ENST00000611683 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MKRN4PQ13434 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms