Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CCDC15Q0P6D6 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SYBU-204ENST00000408908 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CCDC15Q0P6D6 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.8 ms